本部設下列司、處：
一、綜合規劃司，分四科辦事。
二、法制司，分四科辦事。
三、法律事務司，分六科辦事。
四、檢察司，分五科辦事。
五、保護司，分五科辦事。
六、國際及兩岸法律司，分二科辦事。
七、秘書處，分五科辦事。
八、人事處，分四科辦事。
九、會計處，分四科辦事。
十、統計處，分三科辦事。
十一、資訊處，分六科辦事。

綜合規劃司掌理事項如下：
一、年度施政方針、年度施政計畫、中程施政計畫、先期作業、中長程個
    案計畫、科技計畫之研擬、規劃、協調及督導。
二、施政報告、重大個案計畫之管制、考核及評估。
三、研究發展工作之規劃、研析、推動及管考。
四、行政革新、行政效能與為民服務工作之策劃、研析、推動、督導及考
    核。
五、出國報告、政府出版品之規劃、執行、審核及評估。
六、矯正署業務之聯繫及協調。
七、國會聯絡事務之政策規劃、分析、研擬、執行及管考事項。
八、媒體、公關事務之政策規劃、分析、研擬、執行及管考事項。
九、本部及所屬機關性別平等業務之統籌、協調及督導。
十、其他跨單位之綜合規劃事項。

檢察司掌理事項如下：
一、本部主管刑事法規制（訂）定、修正之研擬、解釋、推動、執行與各
    機關刑事法規研擬制（訂）定、修正、廢止之法制諮商及協助。
二、大赦、特赦、減刑、復權之法律研擬、審議及發給證明。
三、檢察官調度司法警察、參與民事、非訟事件及犯罪被害人補償事件之
    監督。
四、刑事偵查、實行公訴、刑事執行之監督、執行死刑之簽核、協助國民
    法官法之執行及整備。
五、檢察制度與檢察人事之興革研究、檢察官出國進修、考察之規劃及執
    行。
六、各級檢察機關檢察與行政業務之檢查、調查及監督、檢察官評鑑之行
    政事項。
七、律師、法醫師法規之制（訂）定、修正、證照審核與律師相關業務之
    管理及監督。
八、調查局、司法官學院、法醫研究所、廉政署業務聯繫、協調及督導。
九、科技偵查、通訊監察、監護處分、強制治療處分、毒品、洗錢與資恐
    防制業務之政策研擬、推動及執行。
十、其他有關檢察行政事項。

秘書處掌理事項如下：
一、印信典守及文書、檔案之管理。
二、出納、財物、營繕、採購及其他事務管理。
三、本部及所屬機關辦公廳、宿舍等不動產之取得及管理配置。
四、本部及所屬機關辦公廳、宿舍新建、擴建、遷建等營繕工程之審查、
    協調及督導。
五、本部所屬機關辦公廳、宿舍、檔案、財產、車輛管理之督導考核及工
    程施工查核。
六、工友（含技工、駕駛）之管理。
七、本部災害防救之聯繫及安全防護。
八、其他庶務、財物、工程及相關事項。