會計處掌理本部歲計及會計事項。
會計處分設四科,各科掌理事項如下: 一、第一科: (一) 本部及所屬機關歲入、歲出概算、預算、決算之籌劃、審核及編製 事項。 (二) 本部及所屬機關歲入、歲出分配預算及修改分配預算之審核、編製 事項。 (三) 本部及所屬機關歲入、歲出預算之追加、追減及第一預備金、第二 預備金之審核、彙轉事項。 (四) 本部及所屬機關經費流用及預算保留之申請、核轉事項。 (五) 本部及所屬機關年度重要行政計畫預算之編審事項。 (六) 本部及所屬機關歲計事務之建議及督導事項。 (七) 本部所屬機關營繕工程及購置、定製、變賣財物之監標、監驗事項 。 (八) 各監、院、所、校收容人給養之轉分配及支用事項。 二、第二科: (一) 會計制度、方案之研究、規劃及會計法規之研擬事項。 (二) 本部經管各類款項會計憑證之審核、編製事項。 (三) 本部經管各類款項會計報告及績效報告之編製事項。 (四) 有關本部財務收支之審核事項。 (五) 本部營繕工程及購置、定製、變賣財物之監標、監驗事項。 三、第三科: (一) 本部及所屬機關會計人員編制、派免、遷調、考績 (成) 、考核、 獎懲、訓練、退休、資遣、撫卹之處理事項。 (二) 本部所屬機關交代案件會計部分之審查事項。 (三) 本處、所屬會計機構工作報告之彙編、核轉事項。 (四) 本部、所屬各監獄、技能訓練所、戒治所、少年輔育院及少年矯正 學校各項原始憑證之核轉事項。 (五) 本部及所屬機關會計事務及預算執行之督導事項。 (六) 關於本處及所屬會計機構事務電腦化之推行事項。 (七) 本部及所屬機關國有財產增減結存表之審核事項。 (八) 本處文書、收發及印信典守事項。 (九) 不屬於本處其他各科之事項。 四、第四科: (一) 監所作業基金會計制度、方案之研究、規劃及相關法規之研擬事項 。 (二) 本部監所作業基金概算、預算及決算之籌編事項。 (三) 監所作業基金分期實施計畫及收支估計表之編製事項。 (四) 監所作業基金資本支出預算流用及保留事項。 (五) 監所作業基金會計報告及績效報告之編製事項。 (六) 監所作業基金資本支出預算執行督導考核事項。 (七) 監所作業基金管理委員會有關會計事務之研擬處理事項。 (八) 本部監所作業基金營繕工程及購置、定製、變賣財物之監標、監驗 事項。 (九) 本部及所屬機關監所作業基金財產增減結存表之審核事項。 (一○) 本部監督法務財團法人會計事務之督導事項。
參事掌理左列事項: 一、本部一般法案命令之撰擬、研議事項。 二、各單位辦理有關法規事務之會核事項。 三、本部法規之彙整、管制事項。 四、本部立法計畫之撰擬及立法案件之彙辦事項。 五、行政院及其所屬各部會、行、處、局、署研擬制定、修正法規之參與事項。 六、出席行政院召集或各部、會、行、處、局、署首長或副首長召集之有關法規會議事項 。 七、立法院審查本部有關法律案之列席事項。 八、部、次長出席有關會議資料之提供、整理事項。